MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160 plasmid PL131

Total Repeats: 2766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007427	CGA	2	6	128	133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
2	NC_007427	TCG	2	6	211	216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803368
3	NC_007427	AC	3	6	260	265	50 %	0 %	0 %	50 %	76803368
4	NC_007427	CCG	2	6	328	333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
5	NC_007427	GCT	2	6	372	377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803368
6	NC_007427	ACG	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
7	NC_007427	GCC	2	6	459	464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
8	NC_007427	CTCA	2	8	485	492	25 %	25 %	0 %	50 %	76803368
9	NC_007427	ACC	2	6	549	554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76803368
10	NC_007427	TTC	2	6	598	603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803368
11	NC_007427	CA	3	6	650	655	50 %	0 %	0 %	50 %	76803368
12	NC_007427	CCG	2	6	718	723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
13	NC_007427	CT	3	6	734	739	0 %	50 %	0 %	50 %	76803368
14	NC_007427	TC	3	6	746	751	0 %	50 %	0 %	50 %	76803368
15	NC_007427	GCC	2	6	777	782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803368
16	NC_007427	GAC	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
17	NC_007427	GTC	2	6	822	827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803368
18	NC_007427	GAC	2	6	930	935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
19	NC_007427	GAA	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803368
20	NC_007427	TCA	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803368
21	NC_007427	AGA	2	6	1028	1033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803368
22	NC_007427	GGC	2	6	1124	1129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803368
23	NC_007427	CGG	2	6	1140	1145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803368
24	NC_007427	AGGA	2	8	1279	1286	50 %	0 %	50 %	0 %	76803368
25	NC_007427	TCC	2	6	1297	1302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803368
26	NC_007427	CAT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803368
27	NC_007427	CGA	2	6	1352	1357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803368
28	NC_007427	CGAC	2	8	1368	1375	25 %	0 %	25 %	50 %	76803368
29	NC_007427	CGAC	2	8	1445	1452	25 %	0 %	25 %	50 %	76803369
30	NC_007427	T	6	6	1453	1458	0 %	100 %	0 %	0 %	76803369
31	NC_007427	TGG	2	6	1465	1470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803369
32	NC_007427	CGA	2	6	1522	1527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803369
33	NC_007427	TCG	2	6	1631	1636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803369
34	NC_007427	AGC	2	6	1689	1694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007427	GAA	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007427	GTT	2	6	1765	1770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76803370
37	NC_007427	TGAA	2	8	1830	1837	50 %	25 %	25 %	0 %	76803370
38	NC_007427	GAT	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803370
39	NC_007427	CAG	2	6	1942	1947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803370
40	NC_007427	TTC	2	6	1994	1999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803370
41	NC_007427	TAC	2	6	2045	2050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803370
42	NC_007427	ATC	2	6	2126	2131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803370
43	NC_007427	TGT	2	6	2299	2304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76803370
44	NC_007427	AGT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803370
45	NC_007427	CAA	2	6	2552	2557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76803370
46	NC_007427	CCG	2	6	2583	2588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803370
47	NC_007427	CTC	2	6	2597	2602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803370
48	NC_007427	TCG	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803370
49	NC_007427	AAT	2	6	2661	2666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007427	ATA	2	6	2675	2680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007427	TTG	2	6	2685	2690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007427	GTT	2	6	2713	2718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007427	CAG	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007427	CGA	2	6	2897	2902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007427	ACC	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007427	AAC	2	6	2958	2963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007427	GCC	2	6	2976	2981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007427	CCA	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007427	TCCG	2	8	3076	3083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007427	CTCGG	2	10	3088	3097	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_007427	CG	3	6	3109	3114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007427	GGT	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803371
63	NC_007427	ATC	2	6	3228	3233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803371
64	NC_007427	GTC	2	6	3279	3284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803371
65	NC_007427	AAG	2	6	3337	3342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803371
66	NC_007427	GAA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803371
67	NC_007427	GA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	76803371
68	NC_007427	CAG	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
69	NC_007427	GCA	2	6	3435	3440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
70	NC_007427	AGCGGA	2	12	3490	3501	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	76803371
71	NC_007427	GA	3	6	3568	3573	50 %	0 %	50 %	0 %	76803371
72	NC_007427	TCA	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76803371
73	NC_007427	CGA	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
74	NC_007427	CGG	2	6	3718	3723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803371
75	NC_007427	C	6	6	3782	3787	0 %	0 %	0 %	100 %	76803371
76	NC_007427	CAG	2	6	3849	3854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803371
77	NC_007427	GAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76803371
78	NC_007427	TCT	2	6	3986	3991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803371
79	NC_007427	CGA	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007427	TG	3	6	4157	4162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007427	CAC	2	6	4220	4225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_007427	T	6	6	4233	4238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007427	CTC	2	6	4275	4280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007427	CCGC	2	8	4319	4326	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_007427	CAG	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007427	ACG	3	9	4399	4407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007427	TC	3	6	4513	4518	0 %	50 %	0 %	50 %	76803372
88	NC_007427	CTC	2	6	4563	4568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803372
89	NC_007427	CTC	2	6	4667	4672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803373
90	NC_007427	TCG	2	6	4732	4737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803373
91	NC_007427	CGC	2	6	4751	4756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803373
92	NC_007427	CGA	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803373
93	NC_007427	GCG	2	6	4801	4806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803373
94	NC_007427	TCG	2	6	4869	4874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803373
95	NC_007427	CGT	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803373
96	NC_007427	GT	3	6	4963	4968	0 %	50 %	50 %	0 %	76803373
97	NC_007427	GTA	2	6	4997	5002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803373
98	NC_007427	ACG	2	6	5107	5112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803373
99	NC_007427	CGA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803373
100	NC_007427	GCCG	2	8	5221	5228	0 %	0 %	50 %	50 %	76803373
101	NC_007427	TCG	3	9	5237	5245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
102	NC_007427	CCG	2	6	5259	5264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803374
103	NC_007427	CGT	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
104	NC_007427	GTC	2	6	5404	5409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
105	NC_007427	GTA	2	6	5410	5415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76803374
106	NC_007427	TCG	2	6	5418	5423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
107	NC_007427	TCCG	2	8	5495	5502	0 %	25 %	25 %	50 %	76803374
108	NC_007427	CGA	2	6	5541	5546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803374
109	NC_007427	CCG	2	6	5572	5577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76803374
110	NC_007427	TCG	2	6	5582	5587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803374
111	NC_007427	GCTG	2	8	5731	5738	0 %	25 %	50 %	25 %	76803375
112	NC_007427	TCG	3	9	5804	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803375
113	NC_007427	TCG	2	6	5951	5956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803375
114	NC_007427	CGT	2	6	6039	6044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007427	CGC	2	6	6058	6063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007427	TCG	2	6	6104	6109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
117	NC_007427	CTC	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803376
118	NC_007427	GTG	2	6	6160	6165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76803376
119	NC_007427	GTC	2	6	6202	6207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
120	NC_007427	GA	3	6	6263	6268	50 %	0 %	50 %	0 %	76803376
121	NC_007427	CGTC	2	8	6282	6289	0 %	25 %	25 %	50 %	76803376
122	NC_007427	TCG	2	6	6312	6317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
123	NC_007427	GTC	2	6	6334	6339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
124	NC_007427	TCCGC	2	10	6378	6387	0 %	20 %	20 %	60 %	76803376
125	NC_007427	GTC	2	6	6391	6396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
126	NC_007427	TCG	2	6	6416	6421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76803376
127	NC_007427	TTGT	2	8	6483	6490	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007427	GGC	2	6	6618	6623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007427	TGAA	2	8	6756	6763	50 %	25 %	25 %	0 %	76803377
130	NC_007427	GAC	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803377
131	NC_007427	TTC	2	6	6789	6794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	76803377
132	NC_007427	CGA	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76803377
133	NC_007427	CGGGT	2	10	6927	6936	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007427	CCA	2	6	7022	7027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_007427	GAA	2	6	7060	7065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007427	TAT	2	6	7183	7188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007427	GCC	2	6	7191	7196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_007427	C	6	6	7222	7227	0 %	0 %	0 %	100 %	76803378
139	NC_007427	GCTG	2	8	7248	7255	0 %	25 %	50 %	25 %	76803378
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265	NC_007427	GCG	2	6	13455	13460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76803383
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267	NC_007427	CTC	2	6	13517	13522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76803383
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